En ocasiones podemos tener una capa donde tenemos polígonos superpuestos, y necesitamos que uno de ellos esté recortado para que no haya superposición (por ejemplo una parcela grande con una parcela interna, donde realmente tenemos el polígono de la parcela grande sin el hueco).

Para ello se puede aplicar el geoproceso Diferencia de gvSIG, pero con una configuración específica, y unos pasos concretos. En este vídeo podéis ver mejor cómo se aplicaría: